1) Generación de conocimiento para la conservación de la biodiversidad, el manejo y la remediación del capital natural (comunidades, poblaciones, especies de fauna, flora, funga y microbiota del suelo) de los ecosistemas continentales de la Patagonia extraandina, sus interacciones y sus contribuciones al bienestar humano.
2) Prospección y biotecnología de compuestos bioactivos/microorganismos de importancia alimenticia, terapéutica y/o ecológica.
3) Estudio de las cuencas y recursos hídricos, superficiales y subterráneos de la Patagonia extraandina en un contexto de variabilidad y cambio climático y su interrelación con el medio socioambiental.